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瓊脂糖 IP 工具箱的核心:protein A/G 偶聯(lián)密度如何決定抗體封頂量

更新時(shí)間:2025-11-05點(diǎn)擊次數(shù):134

KTD105-CN 把 protein A 密度做到 12–14 mg mL?1 沉降膠,1 mL 膠理論上綁定 25 mg 人 IgG。實(shí)際 Co-IP 只敢用到 1 mg 抗體,因?yàn)榭贵w過(guò)量會(huì)把非特異 Fc 受體蛋白一起拉下。選瓊脂糖先看“mg 抗體 mL?1 膠"而不是“mg 蛋白 A mL?1",前者決定你能放多少裂解液,后者只是廣告數(shù)字。

粒徑 45 µm 還是 90 µm:離心速度差 1 倍,蛋白回收差 5 %

45 µm 細(xì)膠比表面積大,蛋白 A 載量高,但 500 g 離心 30 s 膠膜緊壓,洗滌時(shí)容易裂膠。90 µm 粗膠 300 g 就能沉淀,膠膜松散,IgG 洗脫體積可壓到 50 µL,濃度翻倍。磷酸化信號(hào)弱,優(yōu)先選粗膠;豐度蛋白做質(zhì)譜,細(xì)膠更省抗體。

交聯(lián)度 4 % 與 6 %:0.2 MPa 是重力柱與 FPLC 的分水嶺

4 % 交聯(lián)瓊脂糖耐壓 0.3 MPa,適合 4 °C 重力過(guò)夜孵育,背景干凈。6 % 交聯(lián)把骨架孔徑縮到 60 nm,耐壓 0.5 MPa,可上 ?KTA 跑 2 mL min?1,15 min 完成一次 IP。實(shí)驗(yàn)室沒(méi)有層析柜,直接買(mǎi) 6 %,否則流速一高膠就壓成餅,柱子堵了還得刮膠重填。

封閉方案:0.2 % 明膠讓兔多抗背景直降 70 %

BSA 封閉時(shí),牛 IgG 會(huì)與 protein G 結(jié)合,銀染多出 55 kDa 雜帶。改用 0.2 % 明膠,pH 7.4 37 °C 孵育 1 h,封閉劑自身不帶 IgG,Co-IP 拉下互作蛋白條帶從 12 條減到 3 條,質(zhì)譜鑒定假陽(yáng)性直接腰斬。

酸洗脫 pH 2.7:甘氨酸濃度 0.1 M 足夠,0.2 M 會(huì)把 protein A 一起剝

0.2 M 甘氨酸 pH 2.7 洗脫 10 min,protein A 脫落率 8 %,下游質(zhì)譜多出 45 kDa 污染肽段。降到 0.1 M 甘氨酸,洗脫 5 min 后立刻 1 M Tris 中和,protein A 殘留 < 1 %,膠圖干凈,質(zhì)譜數(shù)據(jù)省一次庫(kù)搜時(shí)間。

再生極限:0.1 M NaOH 循環(huán) 3 次載量掉 15 %

protein A 在 0.1 M NaOH 里 25 °C 半衰期 10 min,CIP 15 min 一次,三次后抗體結(jié)合效率掉到 85 %。把 CIP 換成 0.5 % 乙酸 + 0.5 M NaCl,壽命拉到 10 次,膠面不會(huì)發(fā)黃。寫(xiě) SOP 把 NaOH 濃度鎖死,新人不會(huì)隨手加 0.5 M NaOH 泡一夜,第二天整瓶膠碎成沙。

存儲(chǔ)陷阱:20 % 乙醇放 4 °C 一個(gè)月長(zhǎng)菌

protein A 瓊脂糖含 20 % 乙醇,瓶口一開(kāi)就進(jìn)氣,兩周后長(zhǎng)出白色菌膜,膠面發(fā)臭。分裝 50 % 懸液,Parafilm 封口,?20 °C 速凍,用前室溫回溫,一管一次性用完,背景無(wú)雜帶。

現(xiàn)場(chǎng)驗(yàn)收:拉 500 µg 裂解液看 IgG 重鏈殘留

新到一盒 KTD105-CN,取 2 µg 抗 FLAG,拉 500 µg 293T 裂解液,洗脫液跑 SDS-PAGE,重鏈 55 kDa 條帶灰度 ≤ 5 % 即合格。5 min 完成驗(yàn)收,比測(cè)載量、測(cè)粒徑省事,現(xiàn)場(chǎng)就能判定退貨還是留用。


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